Ninja Golf est un jeu d'action d'arcade qui combine un jeu de golf avec un jeu de combat à défilement latéral. Vous êtes un ninja, et votre objectif est de survivre à neuf trous de golf ninja! Sur chacun des trous, vous alternez entre le golf et les parties d'action. D'abord vous frappez la balle en sélectionnant la direction et la distance de la vue aérienne au bas de l'écran; Ensuite, vous devrez courir jusqu'à l'endroit où votre balle a été touchée tout en vous défendant des nombreux ennemis. Selon le terrain que vous devez traverser, divers ninjas ennemis, grenouilles géantes, requins tueurs, serpents et autres ennemis se mettront en travers de votre chemin. Pour éliminer les ennemis, vous pouvez frapper, taper ou utiliser une étoile de lancer. Plusieurs bonus peuvent être trouvés de temps en temps; invincibilité temporaire, vie supplémentaire, restauration de la santé, ou transport magique vers le green peuvent apparaître sur l'écran. Une fois que vous avez atteint le green, vous devrez vaincre un dragon cracheur de feu qui garde le trou. Le parcours de neuf trous augmente progressivement en difficulté et comporte des parcours par 3, par 4 et par 5.
