April O'Neil, l'amie journaliste des Tortues Ninja, est kidnappée par Shredder et ses sbires, Bebop et Rocksteady. Les quatre Tortues Ninja: Raphael, Michelangelo, Donatello et Leonardo se frayent un chemin à travers des hordes de fantassins pour sauver April. Ils affrontent le savant fou Baxter Stockman, le général Traag de la Dimension X et le cerveau extraterrestre Krang, jusqu'à l'affrontement final avec Shredder lui-même.
Teenage Mutant Ninja Turtles est un jeu d'arcade réalisé par Konami au plus fort de la popularité de la série de dessins animés. Selon la version du jeu, jusqu'à deux, trois ou quatre joueurs peuvent prendre part à l'action. Le jeu se joue comme un Double Dragon simplifié. À la fin de chaque niveau, les joueurs rencontrent un boss (ou deux boss en tandem, comme Bebop et Rocksteady).